小沙弥入内通报，法海却端坐禅房不动，只让小沙弥传话：“许仙已悟破红尘，留在寺中修行，施主请回吧。”
白素贞闻言，急得流下泪来：“禅师何出此言？我与官人夫妻情深，他岂会无故出家？还望禅师慈悲，放他回家。”
法海这才缓步走出，手持佛珠道：“白素贞，你本是山中蛇妖，焉能与凡人婚配？趁早离开许仙，回山继续修行，免得造下罪孽。”
小青在一旁按捺不住，喝道：“老和尚休要多管闲事！我家姐姐与许公子情投意合，关你何事？快放他出来！”
法海怒道：“妖孽竟敢在佛门净地撒野！看我不收了你！”说罢，举起紫金钵盂便要罩向白素贞。白素贞见法海不讲道理，心中悲愤交加，暗道：“我敬你是得道高僧，你却要拆散我夫妻，今日便让你见识见识我的厉害！”
她拔下头上金钗往空中一抛，顿时狂风大作，乌云密布。小青也祭起青竹宝剑，助姐姐一臂之力。白素贞念动咒语，只见西湖之水如巨龙般腾空而起，直往金山寺涌去。这便是民间传说的“水漫金山”。
法海见状，不慌不忙地脱下袈裟往空中一扔，那袈裟顿时化作一道金色屏障，将洪水挡在寺外。但白素贞法力强盛，洪水越涨越高，眼看就要漫过屏障。法海急中生智，敲响了寺中铜钟，钟声悠扬，竟惊动了天庭。玉帝得知白蛇水漫金山，伤及无辜百姓（洪水虽主要冲金山寺，但周边民居也受波及），大怒之下，命雷神电母下界降妖。
就在此时，白素贞因怀孕数月，动了胎气，法力大减。法海趁机抛出紫金钵盂，一道金光闪过，将白素贞罩在其中。小青见姐姐被收，欲要拼命，却被法海用禅杖击退，她知道自己不是对手，只得含恨离去，扬言日后必来报仇。
法海收了白素贞，便要将她镇压在雷峰塔下。许仙在寺中目睹了一切，终于明白白娘子真的是蛇妖，但想起夫妻情深，又见到她为救自己水漫金山，心中悔恨交加，跪地哀求：“禅师，求你放过娘子！一切都是我的错，与她无关！”
法海叹道：“阿弥陀佛，世间情爱，皆为苦海。白素贞水漫金山，伤及生灵，已犯天条，若不镇压，必为祸人间。你二人本是仙凡殊途，此乃宿命，非人力所能为。”说罢，他亲自将紫金钵盂送往西湖边的雷峰塔，命工匠砌入塔基，又念了七七四十九天镇压咒语，这才离去。
塔下，白素贞的声音幽幽传来：“官人，我不怪你，只盼你好生照看我们的孩儿。待雷峰塔倒，西湖水干，我定能出来与你相见……”
许仙听着妻子的留言，肝肠寸断，却无力回天。他失魂落魄地回到临安，不久后，白素贞在塔中诞下一个男婴，被法海派人送出，交与许仙抚养。许仙为孩子取名许仕林，意为“仕进登科，光宗耀祖”。他从此断绝了尘缘，在保和堂一边行医，一边抚养儿子，每日都会遥望雷峰塔，心中默念：“娘子，我等你……”
大家读到此处，想必已明了这段人妖恋的来龙去脉。但若细究起来，这故事背后实有深意。南宋年间，程朱理学已逐渐成为社会主流思想，“存天理，灭人欲”的观念甚嚣尘上，对人性的束缚日益严重。白素贞与许仙的爱情，本质上是对这种礼教束缚的挑战——一个是超越世俗的“妖”，一个是恪守规矩的“人”，他们的结合，恰似对“门当户对”“人妖有别”等观念的公然反抗。